Comparació de CLO₂ i altres desinfectants d'ús habitual
| Rendiment | Diòxid de clor | Preparació del clor | Sal d'amoni quaternària | Àcid peroxiacètic |
| Poder bactericida | matar tots els microorganismes, incloses les espores bacterianes | pot matar tota la multiplicació de bacteris, i pot matar les espores quan hi ha alta densitat | pot matar la majoria de les formes vegetatives de bacteris, no vàlides per a les espores i els bacteriòfags | pot matar tots els microorganismes, incloses les espores |
| Concentració d'ús comú | 0,5-200 ppm | 250-1500 ppm | 1000-5000 ppm | 2000-20000 ppm |
| Toxicitat | no tòxic | moderadament tòxic | baixa toxicitat | baixa toxicitat |
| Influència PH | petit | gran, no vàlid si > 8.5 | petit | gran |
| Estimulació de la pell | no | sí | no | sí |
| Residus | no | sí | sí | sí |
| Cost | una mica baix | baix | car | una mica alt |
| Resistència als fàrmacs | no | sí | sí | no |
| Influència de la temperatura | per sota de 50 ℃ | per sota de 50 ℃ | petit | gran |
| Efecte de tres substàncies patògenes | no | sí | no | sí |
| Interferència dels orgànics | petit | gran | petit | gran |
| Olor | petita olor a clo₂ | forta olor a clor | no | forta olor d'àcid acètic |
| Estabilitat | estable | inestable, fàcil de resoldre | estable | inestable, inflamable i combustible |